Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GCLCP48506 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GCLCP48506 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GCLCP48506 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GCLCP48506 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLCP48506 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLCP48506 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLCP48506 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GCLCP48506 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms