Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PPARGP37231 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARGP37231 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PPARGP37231 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms