Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NFKBIAP25963 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
NFKBIAP25963 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms