Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PTPRBP23467 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PTPRBP23467 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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