Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
GCSHP23434 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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GCSHP23434 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GCSHP23434 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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GCSHP23434 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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