Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GM2AP17900 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
GM2AP17900 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
GM2AP17900 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
GM2AP17900 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms