Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
DESP17661 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
DESP17661 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
DESP17661 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms