Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCL3L1P16619 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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