Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ACTN1P12814 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ACTN1P12814 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms