Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHGAP10645 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHGAP10645 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHGAP10645 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHGAP10645 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHGAP10645 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms