Protein–RNA interactions for Protein: P10147

CCL3, C-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3P10147 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3P10147 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3P10147 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3P10147 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3P10147 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3P10147 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3P10147 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3P10147 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3P10147 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CCL3P10147 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CCL3P10147 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CCL3P10147 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCL3P10147 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCL3P10147 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCL3P10147 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCL3P10147 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCL3P10147 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCL3P10147 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCL3P10147 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCL3P10147 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CCL3P10147 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms