Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SMIM10L2BP0DMW5 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms