Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAPPC2BP0DI82 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms