Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSP90AB1P08238 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.8 ms