Protein–RNA interactions for Protein: P05546

SERPIND1, Heparin cofactor 2, humanhuman

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPIND1P05546 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SERPIND1P05546 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms