Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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SFT2D2O95562 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SFT2D2O95562 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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