Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
KDM4AO75164 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms