Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CTSVO60911 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSVO60911 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSVO60911 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSVO60911 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
CTSVO60911 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CTSVO60911 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CTSVO60911 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms