Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTATSF1O43719 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTATSF1O43719 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms