Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SRGAP3O43295 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SRGAP3O43295 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms