Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
J3QRK9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
J3QRK9 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
J3QRK9 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
J3QRK9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms