Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
LINC01387J3KSC0 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms