Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms