Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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