Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
GOLGA8SH3BPF8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
GOLGA8SH3BPF8 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms