Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms