Protein–RNA interactions for Protein: A6NKP2

SDR42E2, Putative short-chain dehydrogenase/reductase family 42E member 2, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDR42E2A6NKP2 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SDR42E2A6NKP2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SDR42E2A6NKP2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms