Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CCDC160A6NGH7 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC160A6NGH7 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms