Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC61Q9Y6R9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms