Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
HCN4Q9Y3Q4 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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HCN4Q9Y3Q4 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HCN4Q9Y3Q4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
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