Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
RHBDD3Q9Y3P4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms