Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PRELID3BQ9Y3B1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PRELID3BQ9Y3B1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms