Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
COPS3Q9UNS2 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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