Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SNX7Q9UNH6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms