Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
FBXO4Q9UKT5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
FBXO4Q9UKT5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms