Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms