Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GJD2Q9UKL4 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms