Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FOXD3Q9UJU5 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FOXD3Q9UJU5 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms