Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.14
CGGBP1Q9UFW8 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CGGBP1Q9UFW8 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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