Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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RNF7Q9UBF6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RNF7Q9UBF6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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