Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CHMP5Q9NZZ3 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CHMP5Q9NZZ3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms