Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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FAM53CQ9NYF3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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