Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HOXC10Q9NYD6 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HOXC10Q9NYD6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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