Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CHCHD3Q9NX63 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CHCHD3Q9NX63 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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