Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
COMMD8Q9NX08 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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