Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TDP1Q9NUW8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TDP1Q9NUW8 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TDP1Q9NUW8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TDP1Q9NUW8 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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TDP1Q9NUW8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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