Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RPRMQ9NS64 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms