Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
POLR1EQ9GZS1 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms