Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL4Q9C0H6 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL4Q9C0H6 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms