Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SMIM3Q9BZL3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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